球队历史
1900–1945
拜仁慕尼黑足球俱乐部是由一个名为MTV1879的官网登录入口当地体操俱乐部的部分成员创建的。这些喜爱足球的成员因不满不被允许加入德国足协，于是决定离开俱乐部，并在1900年2月27日傍晚创建了拜仁慕尼黑足球俱乐部。在创建后的短短几个月，拜仁慕尼黑就以大比分战胜多个同城竞争对手，一举杀入了1900-01赛季的南德足球锦标赛的半决赛。
在接下来的几年中，拜仁获得了多个当地联赛的冠军奖杯，并于1910-1911赛季加入了当地新创建的联赛——“Kreisliga”，这也是巴伐利亚的第一个地区级联赛。拜仁获得了联赛创办初年的冠军，不过，直到1914年第一次世界大战开始以前，拜仁才再次获得了该项赛事的锦标。一战中，德国所有的足球赛事都陷入停顿。
一战结束后的那几年，拜仁慕尼黑获得了几个地区级别比赛的冠军。1926年，球队夺得了历史上第一个南德冠军，两年后，他们再次取得了这一成就。
1932年，拜仁首次在国家级联赛中登顶，当时的教练理查德·科恩率队击败了法兰克福获得了德国联赛冠军。二十世纪三十年代，希特勒政权的到来打乱了拜仁发展的步伐，同为犹太人的球队主席以及教练只好逃离德国。俱乐部的其他一些球员也遭到了清洗，拜仁被嘲讽为“犹太人的俱乐部”。在接下来的几年当中，拜仁无法继续参与全国冠军的竞争，在当地联赛中也仅仅排名中游。
1945–1965
二战结束以后，拜仁加入了当时德国南部的最高级别联赛。在1945年至1963年间，拜仁慕尼黑一共雇佣和解聘了13名教练。1955年，拜仁不幸降级，但仅仅在一个赛季以后，球队便重返Oberliga，并且获得了球队历史上的第一座德国杯奖杯，在决赛中，他们以1比0击败了杜塞尔多夫。此时，拜仁遭遇到了严重的财政问题，并在20世纪50年代末濒临破产。资本家罗兰·恩德勒在此时出手相助，为俱乐部提供了必须的资金，作为回报，恩德勒也成为了球队的领袖。在1963年，Oberliga和其他几个联赛被整合为一个新的联赛，也就是现在的德国足球甲级联赛。一共有5支Oberliga的队伍加入了新组建的联赛，但其中并没有包括当时获得联赛第三的拜仁，理由是拜仁的同城死敌慕尼黑1860获得了当年的冠军，而德国足协当时只允许每个城市有一支球队加入德甲。但在2年之后，拜仁依靠年轻的天才球员弗朗茨·贝肯鲍尔、盖德·穆勒以及塞普·迈耶，成功地杀入了德甲联赛。
1965–1979
拜仁在德甲的第一个赛季最终排名第三位，并且获得了德国杯赛的冠军，这使他们有资格进入下一个赛季的欧洲优胜者杯。次年在欧洲优胜者杯决赛中，依靠弗朗茨·罗特在加时赛中的进球，拜仁1比0力克苏格兰球队格拉斯哥流浪者足球俱乐部夺得了冠军。1967年，拜仁成功卫冕德国杯，但球队在其他战线发挥不佳。1968年，南斯拉夫人布兰科·泽比奇接过帅印，他对纪律的要求非常严格，这为拜仁带来了良好的成绩，他在仅仅使用13名球员的情况下，带领拜仁取得了德国足球历史上第一个德甲联赛和德国杯双冠王。
从1970-1971赛季起，乌多·拉特克开始执掌球队。在他执教的第一个赛季，拜仁就捧起了当年的德国杯。
接下来的1971-1972赛季，拉特克为球队带来了历史上第三座德甲冠军奖盘。对阵沙尔克04的关键战役，是拜仁在慕尼黑奥林匹克体育场进行的第一场正规比赛，也是德甲第一次使用直播技术。这场比赛，拜仁5比1大胜对手，并创下了诸如历史得分最多和进球最多等多项记录。拜仁在接下来的两年实现了德甲三连冠的伟业，并且在1974年欧洲冠军杯决赛的重赛中4比0横扫马德里竞技，夺得冠军。
随后几年，拜仁在国内联赛并不顺利，只是在1975年欧洲冠军杯决赛中击败利兹联捍卫了自己在欧洲的地位。次年的欧洲冠军杯决赛，拜仁打败了法国球队圣埃蒂安足球俱乐部，连续三年在欧洲赛场有所作为。同年拜仁捧得了丰田杯的冠军。在接下来的几年中，拜仁却再也没有获得任何比赛的锦标，弗朗茨·贝肯鲍尔也远赴纽约宇宙进行发展。1979年，塞普·迈耶和乌利·赫内斯宣布退役。
1979–1998
20世纪80年代是拜仁慕尼黑的动荡时期，球队经历了许多人员变化以及财政问题。保罗·布莱特纳和卡尔·海因茨·鲁梅尼格成为了球队的灵魂，他们带领球队在1979-80赛季以及1980-81赛季的联赛中捧起了冠军奖盘，拜仁在那一时期也被称为“布莱特尼格”队。
在此后的两个赛季拜仁仅仅获得了1982年的德国杯。
1983年，乌多·拉特克再次执教球队，布莱特纳同期宣布退役。
1984年，拜仁再获德国杯冠军，并且在6年中5次夺得各项赛事锦标，包括了1985-86赛季的联赛和德国杯的双冠王。但在这10年中，拜仁在欧洲赛场上并没有太多优异表现，只是在1982年和1987年获得了欧洲冠军杯的亚军。
1987年，尤普·海因克斯成为了拜仁的主教练。在1988-89赛季以及1989-90赛季的德甲两连冠后，拜仁的成绩开始出现下滑。在1990-91赛季德甲屈居亚军后，1991-92赛季拜仁仅仅排名第10，领先降级区5分。1993-94赛季后半段，当时的主席贝肯鲍尔亲自出马，接过了拜仁的帅鞭，带领球队在沉寂四年之后重新捧起德甲冠军奖盘。
在此之后，继任的乔瓦尼·特拉帕托尼和奥托·雷哈格尔并没有像俱乐部所期待的那样，只是分别在拜仁度过了一个碌碌无为的赛季。由于当时拜仁球员通常登上八卦新闻版面而非体育新闻，拜仁被戏称为“绿茵好莱坞”。在1995-96赛季接近结束时，贝肯鲍尔作为代理教练暂时掌管了拜仁，球队随后夺得了1995-96赛季欧洲联盟杯，决赛中他们击败了波尔多。1996-97赛季，特拉帕托尼重返球队并带领拜仁捧起了当年的德甲冠军奖盘。但在接下来的一个赛季，拜仁在冠军争夺战中输给了雷哈格尔带领的升级马凯泽斯劳滕，特拉帕托尼也再次离开了俱乐部。
1998–2013
在1998-2004年间，拜仁由奥特马·希斯菲尔德执教。在他执教的第一个赛季，拜仁获得了当年的德甲联赛冠军，欧洲冠军联赛冠军也几乎到手，只是在全场领先的情况下被曼联伤停补时阶段的两粒进球所击败。在1999-00赛季，拜仁获得了历史上第三个联赛和德国杯赛双冠王。
2000-01赛季，拜仁直到联赛的最后一轮才确定取得连续第三个德甲冠军，当时在联赛最后一轮，在比赛进行到90分钟却被对手汉堡足球俱乐部射手谢尔盖·巴巴雷茨攻破球门，使得冠军就要旁落的不利情况下，凭借帕特里克·安德森在补时阶段最后时刻的禁区内间接任意球逼平汉堡队，在最后时刻夺得德甲冠军。不久之后，拜仁在欧洲冠军杯决赛上依靠点球击败了巴伦西亚足球俱乐部，在时隔25年之后重新捧起欧洲冠军杯。
2001-02赛季初，拜仁获得了丰田杯的冠军，但之后球队在其它赛事乏善可陈。
2002-03赛季，拜仁获得了球队历史上的第四个联赛和德国杯双冠王，领先第二名斯图加特16分的成绩也创造了德甲联赛的历史，同年拜仁参加了西亚海湾邀请赛，遭遇替补出赛的中国冠军大连实德，拜仁最终3-1取胜，这也是拜仁在中国球队身上丢的第一个失球。
希斯菲尔德的王朝在2004年终结，该年拜仁的表现令人失望，并且在德国杯赛也负于乙级球队亚琛足球俱乐部而止步不前。菲利克斯·马加特接过了球队的教鞭，并带领拜仁获得了两个联赛和德国杯赛双冠王。在2005-06赛季开始之初，拜仁的主场由原来的奥林匹克体育场搬迁至了新的安联竞技场，新的球场同样是与同城对手慕尼黑1860足球俱乐部共同拥有。拜仁在2006-07赛季的表现并不稳定，联赛表现不佳并且在德国杯赛再次输给了亚琛，马加特也在冬歇期过后不久离开了帅位。
2007年1月奥特马·希斯菲尔德重返球队，但拜仁在2006-07赛季最终仅仅获得了第四名的成绩，首次无缘欧冠比赛，并且在其他战线一无所获。在2007-08赛季赛季开始前，拜仁对球队的阵容进行了大刀阔斧的改造和重建。球队一共签下了8名球员并且出售、解雇或者外借了9名球员。其中，最重要的引援是从佛罗伦萨引进卢卡·托尼、从云达不莱梅足球俱乐部引进米罗斯拉夫·克洛泽以及从马赛引进了弗兰克·里贝里。新的引援成功奏效，他们再次获得了2008年的双冠王，并从联赛开始起就一直占据榜首位置。
2008年1月11日，克林斯曼以希斯菲尔德继任者的身份与拜仁慕尼黑签约，他从2008年7月1日起主管球队。拜仁在2008-09赛季迎来了一个糟糕的开局，前6轮比赛中只胜2场，但之后稳步改进。在德国杯的四分之一决赛拜仁被勒沃库森击败；在欧洲冠军联赛中拜仁也在总比分12-1击败了葡萄牙体育俱乐部并创造了欧冠淘汰赛最悬殊比分记录后，被巴塞罗那以5-1淘汰出局。4月27日，也是主场败给沙尔克04并滑落至联赛第3后，克林斯曼被迫下课，前来取代他的是老帅尤普·海因克斯，他的任期一直到赛季结束。球队最终获得了联赛第二名，顺利晋级下一赛季的欧洲冠军联赛。
2009-10赛季，拜仁聘请了荷兰名帅范加尔，并从皇家马德里引进了荷兰小飞侠罗本。在2009-10赛季，拜仁虽开局不佳，不过在上半程后期状态明显回升，最终在冬歇期时获得第三。在第33轮联赛中，拜仁以3-1击败波鸿，提前一轮夺得联赛冠军。而在当赛季的欧冠中，拜仁获得小组第二淘汰赛中先后淘汰佛罗伦萨、曼联和里昂与国际米兰会师决赛，最终以0: KY Gaming 2不敌对手获得亚军。该赛季拜仁也在德国杯中问鼎，焕然一新的拜仁在赛季中与三冠王檫肩而过。
2011-12赛季欧洲冠军联赛决赛，拜仁慕尼黑在主场迎战切尔西，鏖战120分钟1:1平局收场，只能进入残酷的点球大战，最终以总比分4:5（点球3：4）惜败，夺得2011-12赛季欧洲冠军联赛亚军。
2013赛季，拜仁就是为创造纪录而生的，在联赛中提前6轮获得德甲冠军，创造了德甲50年历史中最快的夺冠纪录。德国杯半决赛6-1横扫狼堡队史第19次杀入德国杯的决赛，比赛中戈麦斯6分钟完成帽子戏法让他与荷兰足坛名宿巴斯滕比肩。
2012-13赛季欧洲冠军联赛半决赛首回合拜仁慕尼黑主场较4-0大胜巴塞罗那。次回合拜仁客场挑战巴萨，罗本和穆勒建功，加上皮克的乌龙球，拜仁3-0客场再胜，总比分7-0晋级决赛。拜仁第10次参加决赛，拜仁若能第5度封王将超越巴萨和阿贾克斯、齐平利物浦成为夺冠第3多的俱乐部，落败则变作亚军第一大户（拜仁、尤文、本菲卡都是5次亚军）。
2013年5月25日欧洲冠军联赛决赛凭借罗本与曼朱基齐的进球拜仁慕尼黑队2:1战胜德甲劲旅多特蒙德队第五次称霸欧洲！
2013年6月1日德国杯决赛，拜仁慕尼黑在柏林奥利匹亚球场3:2战胜了斯图加特获得德国杯冠军。这样，拜仁慕尼黑就成为欧洲第七支获得“三冠王” 荣誉的球队，同时也是德国第一支获得此荣誉的球队！
2013年6月27日，拜仁慕尼黑官方宣布与队中首发中场球员里贝里成功续约4年，这样法国老将依然将身披拜仁战袍迎接新帅瓜迪奥拉成为拜仁继续创造辉煌的有力保障。
2013年8月30日，拜仁慕尼黑在布拉格伊甸园球场举行的欧洲超级杯比赛中，两度落后的情况下两度扳平，并在最后点球大战中以5-4击败欧洲联赛冠军切尔西队，首次夺得欧洲超级杯冠军。
2013年12月21日，世界俱乐部杯决赛，欧洲冠军杯冠军拜仁慕尼黑2比0战胜东道主球队拉贾·卡萨布兰卡，获得冠军。同时，也以年度“五冠王”的辉煌战绩完美收官。
2014年3月12日，2013-14赛季欧冠1/8决赛次回合拜仁慕尼黑主场1-1阿森纳，拜仁总比分3-1淘汰枪手。这是欧冠改制后，德甲巨人第13次晋级欧冠八强，枪手则连续4个赛季止步16强赛。第55分钟，施魏因斯泰格先拔头筹；第57分钟，波多尔斯基劲射得分；伤停补时阶段，罗本赢得点球，穆勒罚失。2014年3月25日，因逃税案被判入狱3年半的拜仁主席赫内斯辞掉拜仁慕尼黑俱乐部所有职务。
2014年3月26日，拜仁慕尼黑在客场以3比1轻取柏林赫塔队，在联赛还剩7轮的情况下领先排名第二的多特蒙德队25分之多，提前卫冕德甲冠军。拜仁在上赛季的基础上更进一步，在德甲51年历史上首次三月份就捧起冠军奖盘。
2015年12月21日，拜仁传来好消息！四名巨星同俱乐部完成续约！阿隆索与拜仁续约至2017年，而博阿滕、马丁内斯和穆勒都将自己的合约延长到了2021年！
2016年4月20日，拜仁再与一镇队柱石续下长约！世界最佳门将之一曼努埃尔·诺伊尔于周三与拜仁慕尼黑俱乐部将目前2019年夏天截止的合同延长至2021年6月30日！
2016年5月10日，拜仁慕尼黑俱乐部官方宣布，从本菲卡签下18岁葡萄牙国脚，中场小将雷纳托·桑切斯！这位欧洲最受瞩目的天才新秀之一将从2016/17赛季开始为拜仁效力。在5月9日顺利完成体检之后，双方在慕尼黑签下五年合约，合同至2021年6月30日到期。
2016年5月10日，拜仁慕尼黑俱乐部官方宣布，从多特蒙德签下27岁的德国国脚，世界冠军胡梅尔斯。这位出自拜仁青训的中后卫球员将在完成体检后同拜仁签约五年至2021年6月30日！
球队文化
队徽
拜仁慕尼黑的队徽曾多次变更。拜仁的队徽是全德国乃至全世界最出名的标志，据统计，大约有87%的德国人，89%的法国人，75%的英国人都知道这个标志。拜仁从1921年开始使用队徽，最初，会徽由4个个性化的字母F,C,B,M构成，主色调是蓝色，后来逐渐演变成字母被代表胜利的月桂花环环绕着，随着时间的变迁，代表胜利的桂冠取代了月桂花环。
1954年起，俱乐部采用代表俱乐部颜色的红底白字加兰白方块标志作为队徽，红与白是俱乐部的颜色，蓝白色底象征着巴伐利亚的州旗，而兰白色的小方块则是慕尼黑这座自由城市的象征，本来俱乐部后边的E.V是代表协会的标志。从2002年2月起,俱乐部改组为股份公司，队徽中的EV被取消。长期以来，拜仁的会徽主色调是蓝色和红色。拜仁当前的会徽是一个写有FC Bayern München的红色圆环包裹着巴伐利亚州州旗。
球衣
2016年5月14日拜仁慕尼黑将在安联主场迎来本赛季最后一场对阵汉诺威96的联赛，本场比赛对于已经锁定冠军的拜仁来说，庆祝是最重大的意义，为此球队将身着全新推出的2016/17赛季主场比赛服亮相！
拜仁慕尼黑本赛季第26次赢得德国顶级联赛冠军，其中25次为德甲联赛成立之后所获，因此球队下赛季将在衣袖上佩戴专门设计的“德甲25冠”臂章来纪念这一里程碑式的成绩。
慈善事业
拜仁慕尼黑长期以来一直致力于慈善事业，资助其它遭遇财政危机的足球俱乐部以及遭遇不幸的普通民众。2004年印度洋大地震发生后，俱乐部成立了“拜仁互助协会”，旨在为海啸受灾群众募集社会捐款。协会自成立以来共募得来自俱乐部官员及球员的60万欧元善款。该款项除其他事项外，主要用作在斯里兰卡马拉滕凯尼新建一所学校和在亭可马里地区的重建工作。2007年4月，该协会又决定将重点转向资助本地有需要的人士。
俱乐部对于遭遇财政危机的其它球队也特别友善。一直以来，拜仁曾多次向同城对手慕尼黑1860提供无偿友谊赛、低价转会及直接注资等协助措施。此外，当圣保利因财务问题而被德国足球职业联盟威胁取消参赛牌照时，拜仁也与其进行了一场友谊赛，比赛全部收入都归圣保利所有。2009年，当马克·范博梅尔的母队幸运薛达遭遇财政危机时，拜仁也与这家荷兰球队进行了一场慈善赛。另一个较为出名的例子是亚历山大·齐格勒在1993年从德累斯顿迪纳摩的转会。当拜仁为齐格勒支付了高达230万德国马克的转会费时，许多人认为这是对深陷财务困扰的德累斯顿迪纳摩的一笔补助金。2003年，拜仁又对濒临破产的多特蒙德提供了200万欧元的无抵押贷款。拜仁最近一次对其它俱乐部伸出援手是在2013年1月，当亚琛遭遇破产后，拜仁于意大利中部城市蒂沃利与其进行了一场具有慈善意义的友谊赛，尽可能的为对手赚取门票收入。
2013年，德国南部城市帕绍遭遇500年一遇的洪水袭击，大量民众被迫疏散，拜仁董事会主席卡尔-海因茨·鲁梅尼格于同年6月7日宣布将会尽快与受灾当地的球队进行一场慈善比赛，比赛的所有收入将会全部捐献给当地受灾的灾民。
“梯队建设”
1拜仁慕尼黑二队
拜仁二队成立于1900年，在2005年以前曾被称作拜仁业余队，其的主旨是为拜仁青年队的球员在进入一线队前提供实战赛事的平台。球员构成主要是年龄介乎于18至23岁间富潜力的年轻球员，搭配少数富有比赛经验的老队员以提供经验。拜仁二队曾多次参加德国杯，甚至曾有过在这项赛事中与拜仁一线队对垒的经历，那是1977年的第四轮，拜仁二队以3比5败北。拜仁二队最后一次参加德国杯是在2004-05赛季，当时他们进入了四分之一决赛。但从2008年起，预备队不再被允许参加这项赛事。1983和1987年，拜仁二队曾两次进入德国业余冠军赛的决赛，但都分别以0比2负于洪堡和1比4负于杜伊斯堡，与冠军失之交臂。拜仁二队于德国足球地区联赛作赛，主教练为梅赫梅特·绍尔。
拜仁梯队重组之后，拜仁二队正式归入拜仁青训部门。在2003/04赛季，拜仁二队首次有所斩获：他们在德国地区联赛最终夺冠。在接下去的那个赛季（2004/05赛季）他们复制了1995/96赛季的辉煌，在德国杯中闯入1/4决赛。在2007/08赛季，“小拜仁”凭借积分榜第八的成绩闯入下赛季的德丙联赛，并在2008/09赛季中夺得德丙第五的喜人成绩。在接下去的赛季中他们获得第八，而在2010/11赛季拜仁二队则由于伤病问题最终不幸降级，自此之后球队便再次征战地区联赛并在2013/14赛季成功夺冠，只可惜最终未能升入德丙。在过去的这个赛季中，拜仁二队获得巴伐利亚地区联赛的第二名，仅次于升级的维尔茨堡踢球者。而2015/16赛季，海科-弗格尔成为了拜仁二队主帅。
2拜仁青年队
拜仁青年队是俱乐部青训系统的一部分，创立于1902年并在1995年改制。其主旨是为年轻球员提供培训，以使俱乐部能长期延续在国际足坛的重要地位。球队的候选名单不常变动，而年轻球员则可通过训练改变他们的地位，表现优异的球员可以晋身拜仁二队或直接升入职业队。青年队由11个不同年龄的组别构成，共有170多位球员，其中年龄最小的在10岁以下。球队所培养出的一些知名球员包括欧文·哈格里夫斯、托马斯·希策尔斯佩格、菲利普·拉姆、托马斯·穆勒和巴斯蒂安·施魏因斯泰格，其现任部门主管为沃尔夫冈·德雷姆勒。
3拜仁女队
拜仁慕尼黑女子足球队成立于1970年，在1972年至1990年间拜仁女队连续19次问鼎巴伐利亚地区联赛冠军，并在1976年通过加时以4:2击败柏林网球获得德国冠军，而20世纪70年代也是拜仁女队的第一个鼎盛时期。此后在1979年、1982年和1985年，拜仁女队三次打进决赛但都未能夺冠，1988年和1990年两次打入德国杯决赛，但也只是屈居亚军。
1990年德国女子足球甲级联赛创立，拜仁女队也是其中一员，但在首个赛季获得第4名之后，拜仁女队在1991-92赛季排在第11位，从而降入巴伐利亚地区联赛。8年之后，拜仁女队以全胜战绩称霸地区联赛，才得以返回德甲并征战至今。1995年，前德国国脚卡琳-达纳成为经理接管拜仁女队。在新世纪初拜仁女队的最好成绩仅仅是在2002年、2005年和2007年拿到第4名，那段时间拜仁女队也被誉为“球星加工厂”，之后的许多德国国脚都是从拜仁女队加盟其他德甲球队的。2008-09赛季，拜仁女队仅仅以一个净胜球的劣势屈居德甲亚军，但这个成绩帮助她们获得了参加下赛季欧冠的资格。2012年，拜仁女队在科隆举行的德国杯决赛中2:0击败劲旅法兰克福夺冠。 2015年5月10日，拜仁女队在主场2:0战胜埃森之后以不败战绩第二次夺得联赛冠军。2016年5月1日，拜仁女队5比0大胜勒沃库森提前两轮卫冕德甲冠军。
瑞朵
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